La structuration de la recherche au sein de l’UM5 a pour objectif de mettre en œuvre et de mutualiser un ensemble cohérent de moyens et de donner lieu à un haut niveau de compétences, de recherches et d’activités scientifiques que fédèrent ces groupements.
Les centres et les laboratoires ont une finalité interdisciplinaires, alors que les équipes de recherche sont disciplinaires.
L'UM5 a lancé une restructuration de la recherche en 2017 qui a abouti à l'accréditation de :
- Centre des Sciences des Matériaux (CSM)
- Centre de Recherches Mathématiques et Applications de Rabat (CEREMAR)
- Centre de Recherche en Energie (CRE)
- Centre de Biotechnologies Végétale et Microbienne, Biodiversité et Environnement (BIOBIO)
- Geophysics, Natural Patrimony and Green Chemistry Center (GEOPAC)
- Centre Eau, Ressources Naturelles, Environnement et Développement Durable (CERNE)
- Engineering for Smart & Sustainable Systems Research Center
- Centre d’Ingénierie Civil, Eau, Environnement, Géosciences (CICEEG)
- Rabat Information Technology Center (RITC)
- Centre de Recherche en Sciences et Technologies de l'Ingénieur et de la Santé (CRSTI)
- Centre de Biotechnologie Médicale et Innovation (BIO-INOVA)
- Centre de Génomique de Pathologies Humaines (GENOPATH)
- Centre de recherche des Sciences des Médicaments (CRSM)
- Centre Homme, Langues, Civilisations et Religions (HLCR)
- Centre Homme Espace et Société (HES)
- Centre Langues Littératures Arts et Sociétés (2LAS)
- Centre Science Interdisciplinaire des Sciences de l'Education (CISE)
- Centre Interdisciplinaire de Recherche en Performance et Compétitivité (CIRPEC)
- Centre des Etudes Stratégiques en Droit Economie et Gestion (CESDEG)
- Laboratoire de bio statistique, recherche clinique et épidémiologie
- Laboratoire de matière condensée et sciences interdisciplinaires
- Laboratoire conception et systèmes
- Laboratoire ingénierie du tourisme, patrimoine et développement durable des territoires
- Laboratoire histoire, espace, société et culture
- Laboratoire linguistique, aménagement des langues et terminologie
- Laboratoire d’études en droit, droit religieux et économie
- Laboratoire d’études et de recherche en droit public et sciences politiques
- Laboratoire finance entrepreneuriat et développement
- Laboratoire d’études et de recherches juridiques et politiques
- Laboratoire de recherche en management des organisations, droit des affaires et développement durable
- Equipe de recherche en immuno-pathologie
- Equipe Biochimie clinique, métabolique et moléculaire
- Equipe Nutrition gastroenterology and metabolicdiseases
- Equipe de recherche en cytogénétique et culture cellulaire
- Equipe de recherche nouvelles techniques de radiothérapie, amélioration des résultats thérapeutiques et de qualité de vie
- Equipe de recherche en oncologie translationnelle
- Equipe de recherche de psychiatrie, psychologie médicale et histoire de la médecine
- Equipe de recherche en exploration fonctionnelle respiratoire
- Equipe Physique des hautes énergies- modélisation et simulation
- Equipe d’informatique, mathématiques appliquées, intelligence artificielle et reconnaissance de formes
- Equipe Algorithms, networks, intelligent systems and software engineering
- Equipe Intelligent processing and security of systems
- Equipe de science de la matière et du rayonnement
- Equipe de recherche génie mécanique et énergétique: modélisation et expérimentation,
- Equipe Qualité sécurité maintenance
- Equipe Modélisation des systèmes énergétiques, des matériaux et structures mécaniques, et des procédés industriels
- Materials,energy and acoustics team
- Equipe Gouvernance de l'Afrique et du moyen –orient
- Equipe de recherche droit de l'environnement, politique publique et développement durable
- Equipe de recherche interdisciplinaire sur l'Afrique
- Equipe de recherches sur les politiques africaines
- Equipo pluridisciplinar de investigacion sobre el mundohispanico y lusofono